Операции выполняются при помощи свободной программы pdftk (https://www.pdflabs.com/tools/pdftk-the-pdf-toolkit/), она "вшита" вовнутрь. Исходные файлы для склеивания можно добавлять перетаскиванием на форму.
Может работать в обычном и управляемом приложении.