Как правило, бюджетная организация платит аванс только в случае если это предусмотрено договором. Когда заводите договор, вы принимаете бюджетные обязательства в сумме договора и сразу же (при заключении договора) принимаете денежные обязательства на оплату аванса. В документе "Регистрация обязательства" в этом случае указывается сумма договора и в поле "Непосредственно" указывается сумма аванса, и документ при проведении создает проводку на БО и на ДО. Поэтому при проведении "Поступление услуг" проводка на денежные обязательства создается на сумму документа за вычетом суммы взаимозачета Дт 302 Кт 206.
В качестве дополнительное аналитики для учета "Мероприятий" удобно использовать поле "ИФО". Как правило, если деньги выделяются под определенные мероприятия и нужно организовать отдельный учет таких денежных средств и того, на что они пошли - ИФО как ничто другое лучше всего для этого подходит.