1С проект
В роли Пользователь в справочнике договора на Чтении есть шаблон ограничений ОрганизацияВШапкеКонтрагентВШапке, его нужно отредактировать предполагаю.
Предполагаете не совсем правильно.
Да. Этот шаблон можно взять за основу и его подредактировать.
Но затем его нужно будет применить не только к справочнику ДоговорыКонтрагентов, а ко всем объектам (в том числе и регистрам, а возможно, и справочникам), ссылающимся на договор.
Кстати, еще вопрос: А что делать с объектами, где договор указывается в табличной части? Если в таком объекте есть как доступные договора, так и не доступные договора, то давать доступ к такому объекту или нет?