Просьба уточнить как сейчас настроен обмен с сайтом? У вас установлено расширение 1С-Битрикс? Нужно немного больше информации для комплекного понимания проблемы.
Для обмена с БУС(Битрикс управление сайтом) в типовых конфигурациях 1С есть встроенный механизм обмена, его же, в другой версии( в версии самого Битрикс, а не 1С) можно установить как модуль с сайта Битрикс:
https://1c.1c-bitrix.ru/ecommerce/download.php
И там есть обмен заказами.
Для участия в обсуждении Вам необходимо авторизоваться либо зарегистрироваться