Есть такой отчет анализ ндфл по документам-основаниям.Если был излишне удержан ндфл,то там можно посмотреть каким документом эта сумма образовалась.И в самом документе через еще можно посмотреть движение документа.Там будут все записи в регистры ,которые сделал этот документ.