Отчет собирается по Виду номенклатуры.
В отчете нужно поправить так чтобы, если у номенклатуры есть характеристика, она выходила ниже номенклатуры. И только по остаткам
Если у вида номенклатуры и номенклатуры нет характеристик то все должно остаться во внешнем виде как есть.
Пример в файле