Добрый вечер!
Вижу, что галочки в настройках стоят, но автообмен не стартует — часто упирается в регламентные задания или права. Разберусь на копии, скорректирую расписание, настрою автоматизацию. Нужен доступ к тестовой базе, чтобы проверить механику.
Хорошо знаком с УНФ и ЧЗ, и знаю причину вашей проблемы.
У вас включенные настройки запускают обмен подготовленными сообщениями. Создание документа вывода из оборота и команда "Передайте данные" остаются отдельными действиями - это в коде УНФ.
Предлагаю автоматизировать их расширением: создание вывода по подходящим накладным, подписание и отправка по расписанию с контролем ошибок и повторов.