Для документа "Расходы при импорте" добавить кнопку "Распределить на товары". Пользователь указывает таможенную стоимость руками в разделе 1, далее нажимает на эту кнопку и стоимость распределяется пропорционально цене или количеству товара на закладке "Запасы".