Почему нельзя сразу правильную ЕИ выбрать у номенллатуры в документе? Если это разовое исправление уже записанных документов, то это обработкой надо делать. И правильнее и быстрее будет.
Там собственно 2 варианта
1) Восстановление последовательности (это вкратце)
2) Обходное решение, списывать суммы которые не выводятся в 0. Сталкивался с такой ситуацией, гемор еще тот.
База распределенная и тяжелая, участвует 4 подразделения. И интеграция с сайтом. В прошлый раз когда обновлялись прокляли все.
Допилов немного.
"проще всего будет...